Kategória: Blog

  • Čo som sa naučila pri našej prvej pred-registrácii?

    Čo som sa naučila pri našej prvej pred-registrácii?

    Vďaka svojmu kamarátovi Mirovi Sirotovi volanie po otvorenejšej vede registrujem už niekoľko rokov. Obzvlášť sa mi páčila idea transparentnosti, ktorú ponúka pred-registrácia štúdie, hoci som si nebola istá, či sa úplná transparentnosť v opise jednotlivých krokov výskumu nebude biť s potrebou „dobrého príbehu“, ktorý – ako vieme a ako nám odporúčajú príručky akademického písania – zohráva nezanedbateľnú rolu v tom, ktorý článok bude publikovaný a ktorý nie. Dobrým príbehom nemyslím len toľko omieľané akademické snaženie publikovať za každú cenu v honbe za „čiarkami“; ako vášnivého čitateľa mi dobre napísaný príbeh prináša estetické uspokojenie a platí to aj pre vedecké články. Vedecké články (na rozdiel od beletrie) sa nám totiž čítajú dobre vtedy, keď sú logicky vyskladané a smerujú lineárne od predpokladov cez ich otestovanie až k záveru, v ideálnom prípade jednoznačnému. Zároveň všetci, čo sme už nejaké svoje hypotézy testovali a snažili sa o tom koherentne napísať, vieme, že ten proces nie je vždy lineárny a takmer nikdy nie je jednoznačný. V každom okamihu robíte množstvo rozhodnutí, ako príbeh svojich výsledkov opísať tak, aby bol pochopiteľný a logický aj pre ostatných. Preto som mala obavy, že pred-registrácia ma odsúdi na mechanický opis krokov, ktorý bude síce presný a transparentný, ale bude mať ďaleko od záživného príbehu. Tak som vlastnú pred-registráciu odkladala.

    Ako školiteľka som však cítila potrebu apelovať na študentov, aby si zvykli používať čo najviac praktík z otvorenej vedy a pred-registráciu som videla ako spôsob, ktorý im pomôže veľa otázok vyjasniť si skôr než budú dáta zozbierané. No ak som im mala vedieť pomôcť riešiť ich pochybnosti a rozhodnutia, bolo už prakticky nevyhnutné, aby som si to vyskúšala na vlastnej koži. Okrem toho, nechcela som byť ako milovník vína, ktorý odporúča ostatným pitie vody.

    A tak sme sa s kolegyňou Evou dohodli, že náš najbližší výskum pred zberom dát pred-registrujeme. Tu si dovolím malú osobnú vsuvku. S Evou spolupracujeme už od našich doktorandských a post-doc čias a pri každom spoločnom výskume sme sa snažili poučiť, aby sme to na ďalší krát spravili už konečne bez chýb. Evine prehľadné tabuľky pri výbere metód a moja záľuba v kreslení myšlienkových máp na tabuľu nám priniesli nejedno intelektuálne potešenie. No aj tak sme sa skoro vždy zasekli vo fáze písania pri nejakom probléme, kde nás hnevalo, že sme ho nedokázali predvídať skôr. (Kde len spravili súdruhovia z NDR chybu?)

    Na predregistráciu sme si vybrali jednoduchú (aspoň v tom čase sa nám to tak zdalo) replikačnú štúdiu Bouveta a Bonnefona (2015) jednako preto, že nás nadchla téma (experimentálne overenie, či analytické myslenie pomáha pred vierou v astrológiu) a jednako preto, že hoci bol pôvodný experiment zaujímavý, nechal otvorenú otázku, či v skutočnosti naozaj ľudí ochránilo analytické myslenie, alebo skôr išlo o priming toho, že ak ide o astrológiu, tak ľudia s vyšším analytickým myslením sú ostražitejší, avšak v prípade iného podobného podvodu, by naleteli rovnako ako menej analyticky disponovaní ľudia. Preto sme si vymysleli modifikáciu a rátali sme, že pred-registráciu nahodíme na jeden šup a môžeme sa vrhnúť do zbierania dát.

    Samozrejme, rada by som tu napísala, že všetko išlo ako po masle a nie je to žiadna veda, veď navyše nešlo o náš prvý výskum a ešte aj o replikáciu. Ale pravda je taká, že na jeden šup sme to nespravili.

    Na druhej strane, vďaka tomu som si uvedomila, koľko analytických rozhodnutí robíme automaticky a ako sa neustále spoliehame (napriek množstvu opačných skúseností), že to pôjde presne tak, ako sme si naplánovali. Najviac času pri rozhodovaní nám zabral opis, čo presne budeme s dátami robiť. Napríklad, my sme pôvodný dizajn rozšírili aj o zahrnutie paranormálnych vysvetlení a namiesto jednej otázky („Tento opis má úplne vystihuje“) sme položili sedem kontrolných otázok, z ktorých štyri mali merať dôverčivosť a tri paranormálne vs. náhodné vysvetlenia, pretože sme chceli spoľahlivejšiu hlavnú závislú premennú. No pri opise toho, ako budete rátať sumárne skóre sme hneď museli robiť rozhodnutie, či budeme rátať sumár alebo priemer a čo budeme robiť v prípade, ak sa nakoniec ukáže, že naše položky nemerajú jeden faktor (čo sa samozrejme aj stalo). Podobne bolo potrebné dopredu sa zamyslieť nad tým, čo budeme brať ako kontrolu toho, že manipulácia zabrala a aký analytický plán B budeme mať v prípade, že to nevyjde podľa očakávania (čo ani nevyšlo).

    Na základe týchto „drobností“ sme plán niekoľkokrát menili, predstavovali si rôzne možnosti, čo sa môže pokaziť a vracali sa k úprave metód či dizajnu. Z predpokladaného optimistického odhadu „Do týždňa to nahodíme na OSF“ to nakoniec bol skôr mesiac. Výsledok je tu: https://osf.io/u5pzc

    Potom konečne prišiel ten vytúžený moment, keď sme nakoniec dáta mali konečne zozbierané (to na rozdiel od očakávaní trvalo asi len 2 dni) – najväčším nepriateľom výskumníka v tomto okamihu už je len nájdenie dostatočného času na ich vyhodnotenie a spísanie výsledkov. Ani v tomto bode vedecká práca nie je priamočiara a k dátam sme sa dostali kvôli iným neodkladným povinnostiam o oveľa dlhší čas než by nám bolo milé. Možno to niektorí poznáte: Konečne máte vyhradený čas na to, aby ste sa vrhli na analýzu dát … len aby ste zistili, že si nepamätáte presne, čo ktorá premenná v dátovom súbore znamená a čo presne ste s ňou chceli robiť. A tak strávite ťažko ušetrené hodiny opätovným „zoznamovaním“ sa s dátami. Po takejto skúsenosti si poviete, že nabudúce budete analyzovať dáta hneď „za horúca“ … len aby sa nabudúce opakovalo to isté, lebo zrovna je čas čítania záverečných prác a vy ich máte na stole 10. A práve v tomto okamihu sa ukázala prvá úžasná vec na predregistrácii: stačilo si ju otvoriť a krok po kroku sledovať vlastné myšlienkové pochody spred pár mesiacov. V tomto okamihu si prvýkrát uvedomíte, že predĺžený čas venovaný príprave, nebol zďaleka zbytočný a ušetril vám oveľa viac času teraz. Ak by som sa mala odvolať na časové diskontovanie, ktoré ukazuje, že máme tendenciu podceňovať budúce zisky, tak to je možno jeden z dôvodov, prečo tak bezstarostne zahadzujeme svoj čas v budúcnosti. Ale ak sa vám už stalo, že ste sa pustili do práce, o ktorej ste predpokladali, že bude namáhavá a náročná, len aby ste zistili, že ju už niekto spravil za vás, tak si viete živo predstaviť pocit nadšenia a vďačnosti, ktorý vás zachváti, keď zistíte, že ten niekto ste boli vy v minulosti.

    Druhá úžasná vec bola, že keď sme sa pustili do analýzy dát, samozrejme, sa – ako inak? – ukázalo, že nie všetko išlo podľa našich očakávaní. No to, čo by nás za iných okolností minimálne na niekoľko dní (a buďme úprimní, že s najväčšou pravdepodobnosťou na dlhšie) zabrzdilo, bola teraz len drobná nepríjemnosť, ktorá viedla k implementácii analytického plánu B. (A k nečakanému plánu druhej štúdie – ako inak – predregistrovanej: https://osf.io/zj32f.)

    Tretia výhoda („Ó, veľká vďaka „my“ v minulosti!“) sa ukázala pri písaní článku; v zásade stačilo len trochu podrobnejšie rozviesť úvod a dopísať diskusiu a článok bol v rekordnom čase na svete.

    A v neposlednom (a dosť podstatnom) rade – som presvedčená, že sa tým skrátil aj celý recenzný proces. Jednako tým signalizujete svoju sebaistotu a kvalitu, že ste veci dôkladne premysleli dopredu a nebáli ste sa svoj myšlienkový proces vystaviť kritike. Okrem toho sa tým odlíšite od ostatných. (Dá sa trochu dúfať, že to na recenzentov zapôsobí, čo tiež nemusí byť nevýhoda.) A v druhom rade, ako už vo svojich blogoch spomenuli Pali a Jakub, recenzent nemá toľko arzenálu, aby vás či už kvôli retrospektívnej zaujatosti (po bitke je každý generál) alebo pocitu, že jeho preferovaná analytická metóda je lepšia, nútil do často zbytočných štatistických procedúr. Tým nechcem povedať, že nám našu štúdiu neskritizovali. V našom prípade recenzenti naozaj navrhli iný postup, ako sa vysporiadať s tým, na základe akých kritérií vylúčiť participantov (výsledky to aj tak nezmenilo). Čiže naozaj to nie je tak, že predregistrácia je sväté písmo vytesané navždy do kameňa, ktoré vám neumožní ani kúsok flexibility. Ale dá sa jasne odlíšiť, čo ste očakávali a keď sa to nenaplnilo, máte voľné pole rôznych alternatívnych prístupov, ktoré však už každý chápe ako exploračné.

    Aby som to zhrnula do konkrétneho časového rámca: k analýze a spísaniu výsledkov sme sa dostali po uviaznutí na homeoffice v marci 2020. V októbri bol článok po dvoch kolách recenzie (a jednom odmietnutí) už publikovaný: The Effect of Analytic Cognitive Style on Credulity

    A pre mňa bolo podstatné zistenie, že predregistrácia nenarušuje vedecký proces a ani dobrý príbeh. Skôr je to naopak – vďaka záväzku, ktorý ste pripútaním sa k stožiaru (ak použijem Paliho metaforu, ako preplávať morom Sirén) urobili, vstúpili ste do nového príbehu.

    Referencie

    Bouvet, R., & Bonnefon, J. F. (2015). Non-Reflective thinkers are predisposed to attribute supernatural causation to uncanny experiences. Personality and Social Psychology Bulletin, 41(7), 955–961. https://doi.org/10.1177/0146167215585728

    Obrázok je ilustrácia Johna Tenniela z knihy L. Carrola Alice in Wonderland.

  • Podcast náš každodenný… (Časť 1)

    Podcast náš každodenný… (Časť 1)

    Poznáte to. Cestujete denne do školy/práce, venčíte domáceho miláčika alebo len potrebujete zdravotnú prechádzku a neviete, ako efektívne využiť čas – čo by ste si popri tom mohli vypočuť?

    Niektorí z nás môžu preferovať počúvanie klasických audiokníh. Čo ale ak chceme vyskúšať niečo, čo súvisí s oblasťou nášho záujmu, vedou, psychológiou…?

    Elegantným riešením môže byť počúvať knihy alebo články pomocou aplikácie, ktorá dokáže čítať pdf (napr. @voice na android zariadenia). Ide o super riešenie ale nemusí byť vhodné do každej situácie/pre každého.

    Čo vtedy, ak máte práve chuť (alebo vo všeobecnosti preferujete) trochu voľnejší (t.z., menej formálny) formát? Možno Vám napadlo nasledujúce slovo: Podcast.

    Podcast na témy otvorenej vedy/publikovania/výziev…? Prečo nie?

    Pokiaľ patríte do klubu milovníkov podcastov a hľadáte tip na podcast, ktorý by súvisel s témami, ktorým sa na tejto stránke venujeme, prinášam pár tipov na to, čo možno vyskúšať. Možno Vás niečo z toho zaujme:

    Nullius in Verba
    Vedú: Smriti Mehta a Daniël Lakens
    Popis: Podcast prepojuje históriu vedy s jej aktuálnymi výzvami. Inšpirovaný motom Kráľovskej spoločnosti (výzva na overovanie tvrdení skrz empirickú skúsenosť namiesto slepého prijímania autorít) kriticky analyzuje, nie len to, ako sa vedecké metódy vyvíjali a aké implikácie to prináša ale venuje sa aj rôznym problémom ako je „publish or perish“ kultúra alebo nedostatok incentiv pre replikácie.
    Príklady tém: Ako Francis Bacon ovplyvnil moderný empirizmus; Prečo žurnály odmietajú štúdie s nulovými výsledkami

    Everything Hertz
    Vedú: Dan Quintana a James Heathers
    Popis: Podcast predstavuje niekedy satirický, no väčšinou informatívny pohľad na „kuchynu“ akademického sveta. Autori odhaľujú absurdiťu vedy prostredníctvom prípadových štúdií (napr. ako ľahko sa dá zmanipulovať meta-analýza).
    Príklady tém: Prečo 80 % psychologických štúdií nepopisuje metódy dostatočne; Ako „predajné“ služby pre akademikov zneužívajú Open Access

    Two Psychologists Four Beers
    Vedú: Yoel Inbar, Michael Inzlicht, Alexa Tullett
    Popis: Podcast prináša neformálne debaty o tom, ako osobné presvedčenie, politika a moc ovplyvňujú vedu. Hostia sa neboja rozobrať aj „tabu“ otázky, ako je financovanie kontroverzných výskumov.
    Príklady tém: Ako „twitterizácia“ vedcov deformuje akademický diskurz; Prečo niektorí výskumníci odmietajú zdieľať dáta

    More of a Comment Than a Question
    Vedú: Rachel Hartman a Paul Connor
    Popis: Podcast často spája akademické témy (metodologické apsekty a výskumná etika) s analýzou kultúrnych a sociálnych trendov. Hostia často kritizujú zneužívanie vedy v ideologických bojoch.
    Príklady tém: Prečo štúdie o „kultúrnej vojnovej únave“ vyvolali polemiky Ako aktivisti ovplyvňujú výber výskumných tém

    The Black Goat
    Vedú: Sanjay Srivastava, Alexa Tullett, Simine Vazire
    Popis: Podcast predstavuje praktického sprievdodcu pre výskumníkov, ktorí chcú robiť vedu zodpovedne. Témami sú napríklad ako komunikovať neisté výsledky alebo prečo žiadna kariérna fáza nechráni pred etickými omylmi.
    Príklady tém: Metódy, ako učiť štatistiku zaujímavejšie; Ako editori kvalitného časopisu potajme menili recenzie

    The Bayes Factor
    Vedú: Alex Etz a J.P. de Ruiter
    Popis: Podcast pre tých, ktorí chcú pochopiť, prečo Bayesovská štatistika mení pravidlá vedy. Okrem iného ponúka návody (napr. ako interpretovať Bayesovské faktory).
    Príklady tém: Prečo p-hodnota 0.05 nie je „svätý grál“; Rozhovor s editorom o štatistických reformách

    Do skorého počutia.

  • Vizualizácie toho, čo si vieme iba ťažko predstaviť

    Vizualizácie toho, čo si vieme iba ťažko predstaviť

    Mali ste pri štúdiu štatistiky problém s tým, ako si niektoré abstraktné koncepty predstaviť? Pokiaľ ste odpovedali kladne, nie ste sami. Našťastie tu máme mnoho nástrojov, ktoré nám s tým môžu pomôcť.

    Pokiaľ by ste tieto a ďalšie vizualizácie chceli vidieť v akcii a širkom kontexte, môžete sa pozrieť na nedávno vydanú učebnicu štatistiky pre reprodukovateľný výskum.

    Pokiaľ by ste ste však chceli nazrieť na to, či Vás niečo neosloví, pripravili sme tejto príspevok. V tejto pripravíme krátky zoznam toho, čo autora príspevku zaujalo pri surfovaní rôznymi štatistickými stránkami. A nie je toho málo.

    ShinyApps takmer pre všetko…

    Chceli by ste pomôcť s tým, ako by ste si prestaviť (A) p hodnotu, (B) a distribúcii p hodnôt, (C)to, ako spolu súvisia chyba prvého, druhého typu a N? Chcete vidieť ako fungujú (D) intervaly spoľahlivosti alebo rôzne druhy veľkosti efektu, ako je (E) Cohenovo d alebo (F) korelačný koeficient? Chcete vidieť ako funguje (G) bayes faktor? To všetko najdete v blogu R psychologist v rámci vizualitácií autora menom Kristoffer Magnusson.

    Shiny apps pre lepšie porozumenie QRP

    Vyššie spomenuté vizualizácie nie sú jediné, ktoré nás môžu zaujímať. Rozmýšľali niekedy nad tým, aké prirodzené je, že „nájdeme“ štatisticky významný výsledok aj keď je efekt na populačnej úrovni nulový? Ako jednoducho je „mučiť dáta“ a aké negatívne dôsledky to so sebou nesie? Chceli by ste si lepšie predstaviť to, aké dôsledky môžu problematické výskumné praktiky (QRP) mať? Výskušajte nasledujúce odkazy.

    Seeing Theory…

    Od základov pravdepodobnosti, cez intervaly spoľahlivosti, bootrasping a bayesov teorém až po regresiu a anovu vo forme interaktívnych vizualizácií. To všetko ponúka zaujímava stránka Seeing theroy.

  • Odysea, pred-registrácia a nástrahy sedmora morí – Časť II

    Odysea, pred-registrácia a nástrahy sedmora morí – Časť II

    V predchádzajúcom blogu sme hovorili o Odyseovi. Dnes budeme v našom rozprávaní pokračovať.

    Predtým si ale odskočíme do inej knihy, ktorú som si obľúbil počas detstva. Niesla názov Ostrov pokladov. Tajomná mapa, poklad, piráti, dobrodružstvo… Táto kniha ma zaujala z viacerých dôvodov. Prvým, bol ten, že bola napísaná formou komiksu. Mám ale aj jeden vznešenejší dôvod. Pomohla mi uvedomiť si, že keď chcem niekam trafiť, môže sa hodiť mapa. Vlastne, mapa môže niekedy motivovať k samotnej ceste. To ale nie je všetko. Naučila ma taktiež to, že mapa vždy nestačí a niekedy nenájdeme to, čo sme chceli. Alebo presnejšie nájdeme to, čo sme nechceli. Taký už je život. Ale pekne poporiadku…

    Pamätáte si ešte na Odyseov príbeh? V prvej časti sme hovorili o tom, že aj my máme svoje Sirény a jednou z nich môže byť p < 0,05. Povedali sme si o QRP (problematických výskumných praktikách) a tom, že sa od Odysea môžeme niečo priučiť, keďže trosky jeho lode pri Sirénach nenájdeme. Ako to, že prežil, zatiaľ čo, aspoň podľa legiend, ostatní nie?

    V prvom rade vedel o nástrahách Sirén. To ale nestačilo. Vedel niečo aj o sebe. O svojich slabých stránkach. Napadol mu postup, ako tieto dve veci spojiť. Prečo o to píšem v blogu o štatisticko-metodologických aspektoch? Z tohto príbehu sa podľa mňa môžeme niečo naučiť.

    Čo? Môžeme sa „pripútať“ k postupu, ktorý si zvolíme ešte pred analýzou a samotným zberom dát.

    Pripútať? To neznie najlepšie. Na druhej strane, pripútať sa v aute nám môže zachrániť krk. Prečo nie aj tu? Dobre, možno vhodnejším termínom by bolo zaviazať sa, že budem postupovať určitým spôsobom. Ak Vás desí aj termín zaviazať sa, patríte zrejme k mojej generácii. Je to v poriadku. Dá sa to povedať aj ináč. Môžeme si pred cestou vytvoriť mapu k svojmu pokladu a potom túto mapu nasledovať. Tento postup sa nazýva pred-registrácia. Ako to robí? Ako múdry starec sa nás pýta dôležité otázky a nepustí nás, kým si ich nezodpovieme.

    „Pred-registrácia predstavuje protokol, ktorý výskumník vyplní pred realizáciou výskumu. Tento protokol obsahuje informácie o plánovanom výskume (napr. cieľ výskumu, hypotézy, výskumný súbor a počet participantov, administrované nástroje, vyhodnotenie účinnosti experimentálneho zásahu, spôsob štatistickej analýzy, atď.) a slúži jednak ako pomôcka pre zamyslenie sa nad dôležitými aspektmi výskumu a pre ich následné transparentné reportovanie; jednak ako časová schránka, ktorá ho vedie v neskorších fázach výskumu“ (Adamkovič et al., 2020, str. 15).

    Na čo je pred-registrácia užitočná?

    V prvom rade nám pomáha zamyslieť sa nad tým, kam vlastne máme namierené a ako sa tam možno dostať. Neskôr nám poslúži ako mapa, ktorá vedie naše kroky napr. pri následnej štatistickej analýze po tom, ako si ich premyslíme na základe formulácie výskumných otázok a hypotéz. Na to sa totiž taktiež pýta. Tým sa pokúša znížiť výskyt harkingu (viď predošlý blog).

    Keďže v pred-registrácii uvádzame predpokladaný analytický postup, nielen že nám môže pomôcť zamyslieť sa nad ním v ten správny čas – pred našou plavbou – zároveň nám vytvára plán, ktorým sa zaväzujeme postupovať. Tým znižuje výskyt problematických výskumných praktík ako je p-haking.

    To nie je všetko. Tak, ako správny kapitán zváži čo všetko bude potrebovať na cestu a či má zmysel vybrať sa na ňu s malou plťkou, väčšou fregatou alebo lietadlovou loďou, tak nám môže pred-registrácia pomôcť zamyslieť sa na napr. nad tým, koľko ľudí by sme mali v našom výskume mať, aby sme našli efekt, ktorý chceme skúmať. Tým napomáha s riešením problému nízkej štatistickej sily. Alebo aspoň k informovanému rozhodnutiu.

    Ale čo publikačné skreslenie (šuflíkový efekt)? Stále sa predsa môže stať, že náš výskum nakoniec nepublikujeme. Niežeby sme nechceli. Možno to z nejakého dôvodu nechce recenzent alebo editor nášho vysnívaného časopisu. A pritom sme vynaložili toľko úsilia…

    Tento problém sa pokúša vyriešiť špeciálny formát pred-registrácií, zvaný registrovaný výskum/protokol (v origináli označovaný ako RR – Registered reports). Jeho špecifikom je, že recenzné konanie prebehne ešte pred zberom dát.

    Čim je to výhodné? Náš výskumný plán tak môžeme vylepšiť. Ak nám recenzent napr. vytkne, že naša loď je primalá na to, aby nás doviedla do cieľa, môžeme zvážiť využitie väčšej lode (väčší výskumný súbor) prípadne Nautila (ponorka – iný výskumný súbor alebo opakovaný zber) alebo jednoducho zvoliť inú cestu (iný spôsob analýzy dát). Tak pri chybe nemusíme zahodiť celý náš výskum do koša, ale môžeme ho vylepšiť ešte pred tým, než sa vrhneme do terénu. Okrem toho, pokiaľ je náš článok akceptovaný vo fáze 1, časopis nám ho publikuje bez ohľadu na to, čo nájdeme, pokiaľ dodržíme, čo sme sľúbili. Pamätáte si ešte na Ostrov pokladov z úvodu? Či už bude v truhlici zlato alebo nič, naša cesta mala hodnotu! Nemusíme sa báť zlých pirátov…

    Časopisov, ktoré ponúkajú tento formát je stále väčšie množstvo. Neveríte? Pozrite si ich neustále aktualizovaný zoznam na TOMTO ODKAZE. Pokiaľ by ste si chceli prečítať o problematických výskumných praktikách a pred-registrácii viac, môžete nazrieť napr. do prehľadvoej práce Adamkoviča et al. (2019 a 2020) v slovenčine alebo Munafòa et al. (2017) a Nelsona et al. (2018) v anglickom jazyku. Ak máte viac času, skúste knihu „The Seven Deadly Sins of Psychology“ (Chambers, 2017).

    Ide o jedinú vec, ktorú môžeme pre zlepšenie nášho výskumu spraviť? Ani zďaleka. Odyseus mal okrem stĺpu, o ktorý sa priviazal – aby odolal vábeniu Sirén – aj posádku, loď a kopu ďalších vecí. Zároveň je ale podstatné podotknúť, že bez prekonania Sirén by sa Odyseus nedostal k ďalším dobrodružstvám a v konečnom dôsledku k svojmu cieľu.

    Chcete sa vydať na cestu a pripraviť sa na hlas Sirény aj vy? Pozrite si náš ďalší blog Prečo predregistrovať výskum? a Ako predregistrovať, stručný návod podľa aktuálnych štandardov APA, BPS a DGPs. Nezabúdajme ale, že sa termín „odysea“ udomácnil aj na vyjadrenie dlhej a nie vždy ľahkej cesty. Pre ďalšie nástrahy, ale aj radosti z cesty, sledujte naše ďalšie blogy, ktoré aktuálne pripravujeme.

    Referencie (pre obe časti)

    • Adamkovič, M., Baník, G., Kačmár, P., Martončik, M. a Ropovik, I. (2020) Pred-registrácia a registrovaný výskum ako jedny z riešení replikačnej krízy. In M. Kačmárová (Eds.), Kvalita života 2019 (pp. 10-20). Prešovská univerzita v Prešove.
    • Adamkovič, M, Baník, G, Kačmár, P, Martončik, M a Ropovik, I (2019) Problematické výskumné praktiky: čo je to a ako sa im vyvarovať. In I. Piterová, J. Výrost (Eds.), Sociálne procesy a osobnosť 2018 (7-16). Spoločenskovedný ústav CSPV SAV.
    • Chambers, C. (2017). The Seven Deadly Sins of Psychology: A Manifesto for Reforming the Culture of Scientific Practice (1st Edition). Princeton University Press.
    • John, L. K., Loewenstein, G., & Prelec, D. (2012). Measuring the Prevalence of Questionable Research Practices With Incentives for Truth Telling. Psychological Science, 23(5), 524–532. https://doi.org/10.1177/0956797611430953
    • Kerr, N. L. (1998). HARKing: Hypothesizing After the Results are Known. Personality and Social Psychology Review, 2(3), 196–217. https://doi.org/10.1207/s15327957pspr0203_4
    • Munafò, M. R., Nosek, B. A., Bishop, D. V. M., Button, K. S., Chambers, C. D., Sert, N. P. du, Simonsohn, U., Wagenmakers, E.-J., Ware, J. J., & Ioannidis, J. P. A. (2017). A manifesto for reproducible science. Nature Human Behaviour, 1(1), s41562-016-0021–016. https://doi.org/10.1038/s41562-016-0021
    • Nelson, L. D., Simmons, J., & Simonsohn, U. (2018). Psychology’s Renaissance. Annual Review of Psychology, 69(1), 511–534. https://doi.org/10.1146/annurev-psych-122216-011836
    • Simmons, J. P., Nelson, L. D., & Simonsohn, U. (2011). False-Positive Psychology: Undisclosed Flexibility in Data Collection and Analysis Allows Presenting Anything as Significant. Psychological Science, 22(11), 1359–1366. https://doi.org/10.1177/0956797611417632
    • SIRENS (Seirenes)—Half-Bird Women of Greek Mythology. (n.d.). Cit 08. január 2021, z https://www.theoi.com/Pontios/Seirenes.html

    (Obrázok: Odysseus a Sirény; Autor: Ludmila Pokorná; Zdroj Jakub Adámek’s archive (Pokorná’s grandson); adresa: https://cs.wikipedia.org/wiki/Soubor:Odysseus_a_Sireny_Ludi.jpg)

  • Odysea, pred-registrácia a nástrahy sedmora morí – Časť I

    Odysea, pred-registrácia a nástrahy sedmora morí – Časť I

    Kto Vám napadne keď povieme dobrodružstvo, neznámo a nástrahy neľútostného mora? Možno Aquaman alebo Jack Sparrow. Jedným z tých klasickejších príbehov je epos o Odyseovi.

    Jeho vznik sa datuje do čias hlboko pred naším letopočtom. Napriek tomu s nami rezonuje dodnes. Dovoľte mi preto mu venovať trochu priestoru. Nemusíte sa obávať, nebudeme sa snažiť prerozprávavať celý Odyseov príbeh. Pozrieme sa iba na jednu scénu, ktorá je často uchopovaná v literatúre, umení a filme. Scénu, kde musel Odyseus zdolať Sirény.

    Sú nádherné. Ich spevu je takmer nemožné odolať. Neveríte? Spýtajte sa námorníkov, ktorých trosky lodí obklopujú miesto kde Sirény žijú – teda aspoň podľa starých legiend. Ísť za spevom Sirén… Len raz…

    Trosky Odyseovej lode by sme ale pri Sirénach nenašli. Odyseus ich prekonal. Ako? Snažil sa s nimi koketovať? Poprel, že môžu byť problémom a ignoroval ich? Nie. Priviazal sa ku stožiaru.

    Priviazal sa! Napriek tomu, že bol kráľom, bojovníkom a hrdinom, ktorý sa v minulosti vysporiadal s mnohými, na prvý pohľad nebezpečnejšími prekážkami. Vlastne, keď nad tým tak rozmýšľam, možno si s nimi vedel poradiť práve kvôli tomu. A taktiež kvôli rade, ktorú mu dala Kirké.

    Na samotnú stratégiu priviazania sa pozrieme v druhej časti tohto blogu. Predtým sa ale pozrime na to, čoho sa tak veľmi obával. To, pred čím ho Kirké varovala – Sirény.

    Sirény sa uvádzajú v rôznych počtoch a menách. Niektoré zdroje (SIRENS (Seirenes), n.d.) uvádzajú mená ako Θελξιοπη; Θελξινοη; Θελξιεπεια (Charming Voice; Charming-the-Mind…), iné Πεισινοη; Αγλαοφωνος, Μολπη (Affecting-the-Mind; Splendid Sounding…). Všimli ste si tie preklady z Gréčtiny? Nepripomína Vám to niečo?

    Každý z nás má svoje Sirény. Jednou z tých mojich je p < 0,05. p < 0,05 – neznie to krásne? Môžem zamietnuť moju nulovú hypotézu. Hurá…

    Dobre, možno máte lepšie Sirény. Ale ja si za tou mojou stojím. A nie som sám! A práve to môže byť problém. Prečo?

    Dnes už klasická štúdia Simmonsa et al. (2011) poukázala na to, že umelo podliezť stanovené hranice nie nemožné. Vlastne ani zložité. Stačí uplatniť pár postupov – pridať pár ďalších premenných pri analýzach (tzv. kovariátov), selektívne reportovať iba niektoré z výsledkov, skúsiť viacero postupov analýzy dát… p < 0,05.

    Chcete si to vyskúšať? Na TOMTO ODKAZE nájdete simuláciu, ktorú vytvoril Felix Schönbrodt. Skúste si ju viackrát. Prv nastavte skutočný efekt v populácii na relatívne veľký (podľa Cohenových kritérií môžete napr. uviesť d=0.8 a viac). Sledujte ako ľahko sa ukáže štatisticky významný výsledok, keď máte dostatok ľudí – napr. 80 alebo 50 ľudí v jednej experimentálnej podmienke. Zatiaľ je všetko v poriadku.

    Vráťte ukazovatele do pôvodného stavu. Následne skúsme zmeniť simulovaný reálny efekt v populácii na d = 0. Niekoľkokrát stlačte „run new experiment“. Ukázalo sa niečo štatisticky významné? Nie? Skúste to ešte niekoľkokrát…

    Pripomeňme si, že je reálny efekt v populácii nastavený na 0. To znamená že nejestvuje. Teraz skúste niekoľkokrát stlačiť „run new experiment“, kým sa nezobrazí menej jasný zelený riadok – napr. p = 0,06. Čo teraz? Teraz si môžeme skúsiť napr. pridať pár ďalších účastníkov. Alebo kontrolovať rôzne premenné, vynechať niekoľkých outlierov a podobne. Alebo všetko naraz.

    Možno sa Vám skôr či neskôr podarilo podliezť p 0,05. Bolo to náročné? Táto problematická praktika sa nazýva p-hackovanie (p-hacking). S nadľahčením by sa dalo povedať, že mučíme dáta, kým sa nepriznajú k niečomu, o čom vlastne ani nevedeli. Ak ste videli dobrý film o tajných agentoch, viete, o čom je reč.

    Ďalším úzko spätým problémom je tvorba hypotéz potom, ako sa na naše dáta pozrieme. Ide o tzv. HARKing (Kerr, 1998). Nevieme, čo predpokladáme. Pozrieme sa na dáta. Jasné! Takto som to vlastne čakal/a celý čas. Presvedčiť seba je zvyčajne ľahšie než iných.

    Tretím možným problémom je nízka štatistická sila spôsobená tým, že sa nášho výskumu zúčastní menej ľudí (alebo realizujeme menej meraní) než potrebujeme na to, aby sme našli to, čo hľadáme. Máme malú lupu na to, aby sme v kope sena našli našu ihlu.

    Štvrtým problémom je publikačné skreslenie, tiež známe ako šuflíkový efekt. Keď niečo cenné nájdeme, máme tendenciu to ukázať svetu. Pochváliť sa. Ak nie, tak sa tvárime, že sme ani nehľadali. Hodíme to do šuflíka. Možno by sme aj chceli publikovať, ale recenzent nám povie, že by sme mali hľadať ďalej, keďže sme „nič nenašli“. Predstavme si ale šuflíky vedcov po celom svete. Sú prázdne? Plné? Ak plné, čo je v nich? Nevieme. A to je problém. Z toho mála, čo vidíme, si totiž môžeme vytvoriť mylnú predstavu, pokiaľ tam nezaradíme aj to, čo nevidíme.

    Ako to teda všetko môže vyzerať? Pozrime sa na ďalšiu šikovnú simuláciu od Felixa Schönbrodta na TOMTO ODKAZE. Najprv si skúsme nasimulovať situáciu, kde sme si istí, že naša hypotéza funguje (% of a priori true hypotheses = 100), chyba prvého rádu, ktorú sme si zvolili, je 0,001 (α level = 0,001), štatistická sila je 99% (Power (1-β) = 0,99) a nikto v našej výskumnej oblasti nevyužil p-hackovanie (0 % of p-hacked studies). Pekné však?

    Teraz skúsme presúvať jednotlivé bežce a sledovať, čo to robí s výsledkami. Vyskúšajte si rôzne scenáre. Aj ten pesimistický, kde je veľmi nízka nepravdepodobné hypotézy (% of a priori true hypotheses = 0), nízka štatistická sila (dajme tomu 20-30%) a 50% štúdii je p-hacknutých. Desivé?

    Ktorý z týchto dvoch scenárov je pravdivý alebo ku ktorému sa realita približuje? Nevieme. Je ale pravdepodobné, že aspoň niektoré problematické výskumné praktiky využili aspoň niektorí výskumníci aspoň raz (John et al., 2012).

    Môžeme dúfať. Alebo sa obávať.

    Je to všetko čo môžeme spraviť? Nie! Môžeme pridať ruku k dielu tak, že keď sa na výskumnú literatúru pozrie generácia po nás alebo my sami o niekoľko rokov, s úľavou povieme, že to je dobré a vieme sa o to oprieť.

    Ako? Môžeme skúsiť spraviť to, čo Odyseus…

    V tejto prvej časti tohto blogu sme si priblížili, že rovnako ako námorníci, aj my – výskumníci – môžeme naraziť na Sirény. Tak ako Kirké varovala Odysea, aj nás varujú iní. Nielen to. Idú nám príkladom. Tým že sa pripútajú… Chcete si prečítať viac? pokračujte na Odysea, pred-registrácia a nástrahy sedmora morí – Časť II.

    Referencie (pre obe časti)

    • Adamkovič, M., Baník, G., Kačmár, P., Martončik, M. a Ropovik, I. (2020) Pred-registrácia a registrovaný výskum ako jedny z riešení replikačnej krízy. In M. Kačmárová (Eds.), Kvalita života 2019 (pp. 10-20). Prešovská univerzita v Prešove.
    • Adamkovič, M, Baník, G, Kačmár, P, Martončik, M a Ropovik, I (2019) Problematické výskumné praktiky: čo je to a ako sa im vyvarovať. In I. Piterová, J. Výrost (Eds.), Sociálne procesy a osobnosť 2018 (7-16). Spoločenskovedný ústav CSPV SAV.
    • Chambers, C. (2017). The Seven Deadly Sins of Psychology: A Manifesto for Reforming the Culture of Scientific Practice (1st Edition). Princeton University Press.
    • John, L. K., Loewenstein, G., & Prelec, D. (2012). Measuring the Prevalence of Questionable Research Practices With Incentives for Truth Telling. Psychological Science23(5), 524–532. https://doi.org/10.1177/0956797611430953
    • Kerr, N. L. (1998). HARKing: Hypothesizing After the Results are Known. Personality and Social Psychology Review2(3), 196–217. https://doi.org/10.1207/s15327957pspr0203_4
    • Munafò, M. R., Nosek, B. A., Bishop, D. V. M., Button, K. S., Chambers, C. D., Sert, N. P. du, Simonsohn, U., Wagenmakers, E.-J., Ware, J. J., & Ioannidis, J. P. A. (2017). A manifesto for reproducible science. Nature Human Behaviour1(1), s41562-016-0021–016. https://doi.org/10.1038/s41562-016-0021
    • Nelson, L. D., Simmons, J., & Simonsohn, U. (2018). Psychology’s Renaissance. Annual Review of Psychology69(1), 511–534. https://doi.org/10.1146/annurev-psych-122216-011836
    • Simmons, J. P., Nelson, L. D., & Simonsohn, U. (2011). False-Positive Psychology: Undisclosed Flexibility in Data Collection and Analysis Allows Presenting Anything as Significant. Psychological Science22(11), 1359–1366. https://doi.org/10.1177/0956797611417632
    • SIRENS (Seirenes)—Half-Bird Women of Greek Mythology. (n.d.). Cit 08. január 2021, z https://www.theoi.com/Pontios/Seirenes.html

    (Obrázok: Odysseus a Sirény; Autor: Ludmila Pokorná; Zdroj Jakub Adámek’s archive (Pokorná’s grandson); adresa: https://cs.wikipedia.org/wiki/Soubor:Odysseus_a_Sireny_Ludi.jpg

  • Prečo podnázov „Spoločenstvo otvorenej vedy“?

    Prečo podnázov „Spoločenstvo otvorenej vedy“?

    Príbehy. Môžu nás zaujať, pobaviť, inšpirovať… Zoznam by mohol byť dlhý. Za mňa by tu nemalo chýbať to, že sa v nich vieme nájsť. Preskúmať samých seba – to, kto sme, odkiaľ ideme a kam kráčame.

    Prečo o tom hovorím? Vianočné obdobie je plné príbehov. Tých hlbokých a existenčných, ako aj takých, ktoré sú viac povrchné. Tých veselých so šťastným koncom, ako aj takých, ktoré sú smutnejšie…

    Aký príbeh máte najradšej? Možno ide o dobrý film, ktorý si vždy radi pozriete aj keď ste ho videli už toľkokrát, že ho poznáte naspamäť. Alebo ide o knihu, ktorú práve čítate. Možno zatiaľ prvýkrát, ale niečo vo Vás mení. Možno pieseň, alebo niečo čo ste nedávno sami zažili. Práve jeden takýto knižný/filmový príbeh nám napadol, keď sme uvyžovali nad tým, ako by sa mohol volať náš novovznikajúci Reproducibility network. Neboli to Hviezdne vojny; Rambo: Posledná krv; Avengeri: Endgame; alebo Liga spravodlivých. Aj keď majú tieto príbehy niektorí z nás radi, rezonoval s nami jeden omnoho starší príbeh. Šlo o Tolkienov príbeh Pán prsteňov: Spoločenstvo prsteňa. Čítali ste knihu(y)? Videli ste film(y)?

    Ja kedysi dávno. Ako prvé mi preto napadlo, že by som si – predtým, než začnem písať tento blog- mohol znovu pozrieť film. Najlepšie všetky tri a rovno rozšírené verzie. A takteiž prečítať knihy. Aspoň dvakrát. Aj Hobita. A potom pozrieť režisérske komentáre, fan interpretácie a videá s “easter eggs”. Len tak. Pre istotu. Aby som sa nestrápnil, keď ma konfrontuje Tolkienista a taktiež si v tomto predvianočnom období prijemne zaprokrastinoval.

    Odolal som. Možno raz napíšem iný blog s názvom “Po znovu pozretí/prečítaní – 5 vecí v ktorých som sa mýlil”. Teraz sa tomu ale vyhnem. Prečo? Prvý dôvod je pragmatický. Schválne, pozreli ste si na IMDB/v knižnici aká je dĺžka tých filmov/kníh? Môjmu šéfovi a manželke by sa to zrejme nepáčilo. Druhý je hlbší. Takto môžem autentickejšie hovoriť o tom, čo vo mne rezonovalo aj po dlhých rokoch a čo mi napadlo, keď sme hovorili o možnom názve RN.

    Spoločenstvo prsteňa… Pamätám si skupinu rozmanitých ľudí. Dobre, nešlo iba o ľudí. Bol tam človek, čarodejník, elf…Nepripomína Vám to niečo? Keď sledujem ako kolega pracuje v Rku, mám pocit, že je stelesnením Gandalfa. Keď vidím ako niektorí dokážu vydolovať zlaté nugety (a.k.a karenty) z toho, čo sa mne zdalo ako dávna vyprahlá pôda, vidím chrabrých trpaslíkov. Keď sledujem zasadnutia renovovaných vedeckých spolkov so zvučnými menami, zdá sa mi, ako by tam zasadali dedičia kráľovského trónu a keď vidím ako niekto prezentuje výsledky svojho veľkolepého projektu alebo spomína ako zdolal recenzenta č.2, pripomína mi impoznatného nesmrteľného elfa (a nemusí pritom ani vyzerať ako Orlando Bloom).

    Ako niekedy vidím(e) seba? Kto nám to ešte zostal? Aha. Ehm, malý bezvýznamný hobbit. Viete ale čo mám na tom príbehu najradšej? Ten hobbit nebol bezvýznamný. V niektorých momentoch bol dokonca kľúčový. Rovnako ako boli v iných momentoch kľúčoví ostatní. Čo je na tom také super? Neboli sami. Dopĺňali sa. Spolu s tvorili spoločenstvo. Šli bok po boku. Navzdory nepriazni osudu. Spájalo ich niečo väčšie, než boli oni.

    Čo sa mi na tom príbehu ešte páčilo? Frodo nebojoval iba proti Sauronovi. Musel bojovať aj so sebou a odolávať moci prsteňa. Viete čo ten prsteň prestavoval? Prečo ho Sauron tak veľmi chcel? Popravde, ja už nie. Ale pamätám si aké jednoduché a lákavé ho bolo nasadiť a stať sa na chvíľu neviditeľným. Nikto už nemôže vidieť moje chyby. Som v bezpečí… Milášik!

    Kde bol problém? Keď si ho Frodo nasadil, celý svet bol sa stal rozmazaným. Frodo už viac nevidel jasne. Stratil zo zreteľa širšiu perspektívu. Stratil zo zreteľa iných. Videl len seba a objekt svojich túžob. Pohlcovalo ho to. Stále viac.

    Nie je to niekedy podobné aj s nami? Nie je ľahšie byť netransparentný? Keď nik nemôže vidieť moje nedokonalé dáta; môj možno chybný kód; môj materiál s preklepom; moje štatisticky nevýznamné výsledky… Potrebujem publikovať – chcem tak veľa…?

    Nepohlcuje nás to niekedy podobne ako Froda?

    V spomínanom príbehu nešlo o krátku alebo o ľahkú cestu. Ako to teda Frodo zvládol? Nebol v tom sám. Mal spoločenstvo prsteňa. Spolu sa vydali na dobrodružstvo a spolu nim kráčali.

    Neviem kto ste. Možno “múdry Gandalf”, možno “veľký elf”, možno “obyčajný človek”, možno “iba malý hobbit”… To, čo ale viem je, že sa pred nami otvára nové dobrodružstvo a pokiaľ budete chcieť, môžete sa pridať. Chceme sa vzájomne povzbudzovať k tomu, aby sme boli vo svojom výskume transparentnejší. Chceme sa jeden od druhého učiť a zlepšovať. Krok za krokom. Lebo tak začína každá cesta.

    There’s some good in this world, Mr. Frodo… and it’s worth fighting for.

    — Sam Gamgee